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“精准医学与药物基因组测序应用最新技术与数据分析”系统培训班

2018年10月26日 9:00 ~ 2018年10月29日 17:00

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    近年来,随着我国精准医疗产业迅速发展,精准医疗技术的研究与应用取得了长足的进步。精准医学研究作为科技部国家重点研发计划重点专项,对构建国家大型健康队列和重大疾病专病队列,建立多层次生物医学大数据共享平台,建立大规模疾病预警、诊断、治疗与疗效评价体系等方面具有重要意义,是显著提升人口健康水平、实施健康中国战略过程中不可或缺的一部分。

    精准医学的最终目的是实现对于疾病和特定患者的个体化精准治疗,提高疾病的诊治与预防效益,而精准用药正是实现这一目标的重要环节。在医药分开持续推进的过程中,药师转型的速度明显加快,药师群体也希望提升自身业务水平以适应这次改革浪潮。同时,近几年基因检测飞速发展,测序技术的突破也带动了药物基因组学的发展,这为临床提出了更高要求。为进一步推动我国生物信息学方面的发展,提高从业人员的技术水平,北京中科云畅应用技术研究院举办精准医学与药物基因组数据分析”高级培训班,并由北京中科润开生物科技有限公司具体承办,具体事宜通知如下:

     

    一、课程特点:

    1、系统介绍科研项目如何从大思路着眼进行海量数据挖掘

    2、结合各大项目实践经验,详细介绍多种数据分析软件的使用方法;

    3、理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行

    4、精心挑选相应的上机软件,为每位学员提供实际操作的机会

    6、课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答

     

    二、培训对象:

    生命组学科、精准医学和中医药研究机构、临床科研人员,大学、医院等专家学者大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、教研室骨干人员、教学管理人员;科研单位从事医学、生物、生命科学、相关人员;生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。

     

    三、时间地点  可咨询:邮箱:472355722@qq.com 

        

    2018年1026——1029    北京矿业大学 国际交流中心

    (时间安排:第1天报到,授课3

     、培训内容

       

        章节

       内 容

    基因组学技术在临床中的应用

    1.外显子捕获测序(WES)技术

    2.WES筛选疾病致病基因策略

    3.基于NGS的肿瘤个体化数据分析

    4.临床案例分析

    5.生存分析基本概念以及常用分析方法

    基因组学技术在致病基因发现

    1.药物基因组学分析

    2.临床案例分析

    3.应用二代测序技术研究发病机理、开发临检标志物

    宏基因组与精准医疗

    1.16S rDNA AMPLICON SEQUENCING 法

    1.1. 测序平台、引物设计及区域选择不同测序平台、针对细菌、真菌不同微生物实验设计

    1.2. 测序量及采样建议

    1.3. 分析流程图

    1.4. 结果解析

    2. DSS (direct shotgun sequencing)法

    R语言绘图(ggplot2

    R语言基本介绍

    1、 R语言基本运算、向量函数

    3、R语言数据读入以及导出

    4、ggplot2基本绘图 (条形图、散点图、折线图等)

    5、部分生存分析实例讲

    变异位点分析软件GATK上机操作

    1.基本信息分析: raw data 数据整理及数据质量评估;

    2.数据通过GATK, SAMtools 等检测SNP 和InDel 变异信息;

    3.将SNP 和InDel 与dbSNP 和千人基因组数据进行比对分析;

    4.变异所在基因的功能注释;

    16S分析软件QIIME上机操作

    一、Linux系统操作简介

    1.1 Linux简史

    1.2 Linux与生物信息学

    1.3 Linux基本命令

    1.4 Linux基本操作综合实践

    二、QIIME上机操作

    1. 笔记本电脑配置要求建议笔记本内存4G以上,64位操作系统

    2. 针对16S rDNA amplicon sequencing分析

    2.1. 虚拟机安装:Virtual Box

    2.2. 16S分析运行环境搭建:QIIME Virtual Machine

    2.3. 实例演示及结果展示

    数据预处理

    OTU 聚类

    物种注释

    OTU table生成

    α多样性分析

    序列比对

    构建进化树

    β多样性分析

    3. 针对shotgun sequencing分析(只做流程演示讲解)

    3.1. 序列质量控制:fastqc

    3.2. 序列拼接

    3.3. 基因预测及丰度分析

    3.4. 物种注释

    3.4. 功能注释

    3.5. MetaSPAdes、MEGAN、metAMOS等软件介绍

     

    五、主讲专家:

    中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室 胡主任,拥有丰富的科研及工程技术经验,长期从事生物信息领域项目研究,具有资深的技术底蕴和专业背景。

     

    六、关于证书学员经培训考试合格后可以获得:

    1.北京中科云畅应用技术研究院颁发的生物信息培训班结业证书

    2.注:请学员提供身份证复印件一张

     

    七、报名办法及费用:

         学费3900元含报名费、培训费资料费上机费等相关费用)食宿统一安排,费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训,各单位也可直接报名参加,报名回执表请邮件回复至会务组。 

     

     



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