高通量测序应用最新技术与数据分析”培训班
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随着众多生物基因组测序项目的完成，生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据，已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。为进一步推动我国生物信息学方面的发展，提高从业人员的技术水平，由北京中科云畅应用技术研究院举办“高通量测序应用最新技术与数据分析”高级培训班，并由北京中科润开生物科技有限公司具体承办，具体事宜通知如下：
一、课程特点：
1、系统介绍科研项目如何从大思路着眼进行海量数据挖掘；
2、结合各大项目实践经验，详细介绍多种数据分析软件的使用方法；
3、经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案；
4、理论课与实践课相结合，讲师与学员研讨的方式进行；
5、精心挑选相应的上机软件，为每位学员提供实际操作的机会；
6、课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答。
二、培训对象：
大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员；科研单位从事生物、生命科学、微生物研究的相关人员；生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。
三、时间地点： 2018年7月20日——7月24日 昆明 （西双版纳大厦）
可咨询：18310280875
（时间安排：第1天报到，授课4天）
四 、培训内容
章节 | 内 容 | ||
7.21 第一天 | 生物信息学介绍与前沿技术动态 |
3900元/人 | |
新物种基因组测序策略及基因组文章构成分析 | 1、 新物种的基因组测序的意义 2、 基因组从头测序技术路线 3、 数据获得与处理 4、 基因组基本分析 | ||
新物种基因组测序策略及基因组文章构成分析 | 1、 转录组基本分析 2、 基因组比较分析 3、 数据挖掘与生物功能 4、基因组文章构思的关键基本共识
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微生物基因组学
| 1、微生物基因组研究概况 2、 微生物基因组的特点 3微生物基因组研究的意义 4、 原核生物转录组学研究 5、 单个基因组分析流程 6、泛基因组分析流程 宏基因组/宏转录组的应用
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7.22 第二天 | Linux命令简介 | 1、 Linux背景介绍 2、 常用命令 3、 权限管理 4、 进程查看等 | |
R语言基础以及ggplot2绘图 | 1、 R语言基本介绍 2、 R语言基本运算、向量函数 3、 R语言数据读入以及导出 4、 ggplot2基本绘图 （条形图、散点图、折线图等） | ||
7.23 第三天 | 使用R语言进行生物信息学相关的分析
| 1、高通量测序RNA-seq数据的格式、质量值计算、优缺点 2、无参考基因组-数据拼接软件介绍 3、表达量计算软件介绍 上机操作实习： （i）利用bioconductor包EdgeR进行差异基因分析 （ii）利用bioconductor包degeR进行差异基因分析 （iii）利用热图进行聚类分析 （iv）GO、KEGG等功能聚类分析及用perl语言实现 BioEdit、WEGO等常用生物软件介绍
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7.24 第四天 | 生物信息学专业常用工具及绘图方法 | 1、 利用fastQC进行质量评估 2、 BLAST简单介绍 3、 微生物基因组圈图（CGview, OGdraw） 4、 功能注释（KEGG（KAAS），Islandviewer，ARDB） 5、 进化树分析（模型评估，进化树构建，注释）MEGA 6、 泛基因组学分析（PanGP） |
900元/人 |
生物信息学专业常用工具及绘图方法 | 1、Perl语言入门 2、基因组大小评估 3、基因组拼接质量评估 （i） N50统计 （ii） 根据比对结果统计深度和覆盖度 （iii）碱基GC含量等信息统计 4、基因结构预测结果展示和提取 （i）GFF文件介绍 （ii）GFF内容提取 5、使用circos绘制基因组圈图 |
五、主讲专家：
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室 胡松年老师，拥有丰富的科研及工程技术经验，长期从事生物信息领域项目研究，具有资深的技术底蕴和专业背景。
六、关于证书：学员经培训考试合格后可以获得：
1．由北京中科云畅应用技术研究院颁发的生物信息培训班结业证书。
2．注：请学员提供身份证复印件一张。
七、报名费用：
前三天课程费用3900元/人，为必选。最后一天课程900元/人,可按照需求选择,四天课程共4800，选择全部课程可优惠500元，优惠后价格4300元（含报名费、培训费、资料费、等相关费用）食宿统一安排，费用自理。
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